Das Fox River Staats Gefängnis, so der offizielle Name, ist ein Hochsicherheitsgefängnis in Joliet im US-Bundesstaat Illinois. Die Aufnahmen von Fox River wurden in dem seit 2002 stillgelegten "Joilet Prison" gemacht.
Die Insassen sind aufgeteilt in einen östlichen und einen westlichen Zellenblock, in der Serie werden sie auch "Block A" und "Block B" genannt. Im südlichen Block, der komplett abgetrennt von den Gefangenen ist, befindet sich die Gefängnisverwaltung. Außerdem gibt es auch noch einen weiteren, vermutlich einen nördlichen, Block, wo sich die Krankenstation und die psychologische Station befinden. Fox River wurde 1907 erbaut und besitzt daher ein riesiges Rohrsystem, welches über die Jahre immer wieder renoviert und erweitert wurde und sich unter dem Gefängnis befindet. Auf Grund dieses alten Rohrsystems gelingt Michael und Co. schließlich auch die Flucht.
Henry Pope, der Direktor von Fox River, hat ein sogenanntes Rehabilitierungsprogramm in Fox River gestartet, wodurch die Insassen ihre Fähigkeiten erweitern und eine schulische Ausbildung machen können. Unter dem Namen "Prison Industies" werden verschiedene Jobs, wie z.B. Landarbeit oder Reparaturen, durchgeführt.
Es laufen jedoch auch Geschäfte unter den Insassen selbst ab. So gibt es verschiedene kleine Grüppchen, die sich um bestimmte Sachen kümmern. Außerdem spalten sich die Insassen in Schwarze und Weiße, wodurch häufig größere Massenschlägereien entstehen.

Michaels Fluchtplan geht durch verschiedene Abteilungen von Fox River, wie man an folgender Karte aus der EntertainmentWeekly sehen kann: Fluchtplan.